Asam lambung juga dapat menyebabkan perubahan struktur dinding di dalam kerongkongan yang kemudian menyebabkan terjadinya penyakit Barrett’s. Penyakit ini merupakan lesi pra kanker.

Di luar saluran cerna, asam lambung yang tinggi dapat menyebar ke gigi, tenggorokan, sinus, pita suara, saluran pernafasan bawah atau asma bahkan sampai ke paru-paru.