Dalam pengkhianat kilat yang dilaksanakan militer Belanda, Komaruddin dijatuhi hukuman mati. Pesan terakhirnya adalah agar jasadnya dimakamkan secara Islam. Komaruddin sempat memerlakan kata "Merdeka" sebelum dieksekusi regu tembak Belanda.

Jasad Yang Ching-Sung alias Komaruddin kini berada di Taman Makam Pahlawan Tenjolaya, peristirahatan terakhir bagi para pahlawan kemerdekaan Indonesia.